期刊简介
本刊以发表各类传染病和非传染性慢性病防治研究成果为主要内容，是中国科技论文统计源期刊和中华预防医学会系列杂志优秀期刊。
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首页>中华疾病控制杂志
- 杂志名称：中华疾病控制杂志
- 主管单位：国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位：中华预防医学会 安徽医科大学
- 国际刊号：1674-3679
- 国内刊号：34-1304/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国科技论文统计源期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), CA 化学文摘(美), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
昆明市静脉吸毒感染者HIV-1env基因C2-V4区序列特征分析
邹森；高占；齐中伟；任莉；胡园园；王铮；洪坤学
关键词：人免疫缺陷病毒1型, 序列分析, 流行病学研究
摘要：目的 分析昆明市静脉吸毒(intravenous drug user,IDU)感染者艾滋病病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1) env基因C2-V4区序列特征及代表性广谱单克隆中和抗体(broadly monoclonal neutralizing antibodies,bmNAbs)的表位变异.方法 在昆明市收集165份IDUHIV-1感染者血浆样品,提取RNA,通过逆转录得到cDNA,巢式聚合酶链反应(nested-polymerase chain reaction,nested-PCR)扩增HIV-1膜蛋白基因C2-V4区,应用BioEdit和MEGA等生物信息软件分析所获得序列的特征,并分析2G12、PGT135、PGT128、b12和VRC01等bmNAbs的表位变异.结果 165条序列主要为CRF08_BC (74.55％)和CRF07_BC (23.03％)重组毒株,各可变环变异程度由小到大为V3区＜C3区＜V4区,并且CRF08_BC样本的C2-C4、V3区、C3区和V4区基因离散率分别大于CRF_07BC的相应区域;V3环顶端四肽存在5种类型:GPGQ(95.76％)、GPGR(1.82％)、GPRQ(1.21％)、GPGL(0.61％)和RPGQ(0.61％);辅助受体主要为CCR5 (97.58％).90％以上的CRF08_BC和CRF07_BC重组毒株存在与2G12识别相关的糖基化位点的缺失;而b12、VRC01、PGT135和PGT128等抗体识别的位点在CRF08_BC和CRF07_BC重组毒株中的变异率低.结论 CRF08_BC和CRF07_BC为昆明市IDU感染者的主要流行毒株;CRF08_BC基因离散率高于CRF07_BC毒株;V3区序列变异程度小于C3区及V4区;2G12、PGT135、PGT128、b12和VRC01等代表性bmNAbs表位在CRF08_BC和CRF07_BC毒株存在不同程度的变异.
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