期刊简介

               本刊以发表各类传染病和非传染性慢性病防治研究成果为主要内容,是中国科技论文统计源期刊和中华预防医学会系列杂志优秀期刊。                

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  • 杂志名称:中华疾病控制杂志
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 安徽医科大学
  • 国际刊号:1674-3679
  • 国内刊号:34-1304/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), CA 化学文摘(美), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中华疾病控制杂志2016年第11期

一株人感染H9N2禽流感病毒高通量测序及序列分析

吴衍恒;师舞阳;林金思;谢颖;周日东

关键词:流感病毒A型, H9N2亚型, 序列分析, 结合部位
摘要:目的 对一株人感染H9N2禽流感病毒进行高通量测序(next-generation sequencing,NGS)分析,探讨其在人群流行的可能性.方法 应用高通量测序技术进行全基因组序列测定(whole genome sequencing,WGS).对8个基因进行相似性检索,构建系统进化树并分析其关键位点的分子特征.结果 8个基因与GenBank基因库相似度高序列的来源不完全一致,系统进化树显示HA基因属于欧亚系Ⅰ群,M基因位于G1-like分支,PB2位于G9-like分支,NA位于一独立分支,PBI,PA,NP,NS均位于SH/F/98-like分支.HA基因裂解位点为PSRSSR/GLF,226位受体结合位点为L.除M2基因S31N突变之外,NA基因茎63~65位缺失,PA和PB2基因未发生L336M和Q591R,E627K等可以增强病毒对哺乳动物适应性的突变,但发现可以增强病毒毒力的突变如M1基因N30D和T215A,PB2基因L89V,NS1基因P42S.除M2基因S31N突变外,NA基因和M2基因的药物结合位点未发生E119G,R152K,H274Y,R292K和L26F,V27A,A30T,G34E等耐药性突变.HA和NA糖基化位点预测结果都有8个糖基化位点,其中分别有7个和5个可靠程度较高.结论 该H9N2禽流感病毒的大部分关键性位点较保守,只有少部分位点发生一定程度进化与变异,在人群引起流行的可能性不大,但需加强分子方面动态监测.