期刊简介

               本刊以发表各类传染病和非传染性慢性病防治研究成果为主要内容,是中国科技论文统计源期刊和中华预防医学会系列杂志优秀期刊。                

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  • 杂志名称:中华疾病控制杂志
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 安徽医科大学
  • 国际刊号:1674-3679
  • 国内刊号:34-1304/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), CA 化学文摘(美), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中华疾病控制杂志2013年第02期

广西分离乙脑病毒全基因组序列特征研究

闭福银;谭毅;陈敏玫;谢艺红;董邕辉;莫建军;杨进业

关键词:脑炎病毒, 基因组, 病毒, 进化
摘要:目的 分析近年来在广西分离的流行性乙型脑炎病毒的全基因组序列特征.方法 使用乙脑病毒的全基因组序列测定引物进行逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增,产物直接测序,拼接后获得全基因组序列.再利用DNASTAR 5.0、ClustalX 1.8等生物信息学软件进行核苷酸序列与乙脑病毒系统进化分析.结果 在广西分离到的乙脑病毒基因组全长均为10 965个核苷酸,从97~ 10 932位核苷酸编码3 432个氨基酸.广西毒株之间的核苷酸同源性为98.2%~99.0%,氨基酸同源性为99.3% ~ 99.8%,与GenBank中收录的其他乙脑病毒的全基因组序列比较发现,核苷酸同源性为83.7% ~ 99.1%,氨基酸同源性为94.6% ~99.7%;与目前使用的减毒活疫苗株SA14-14-2比较,核苷酸同源性为88.6% ~ 88.9%,氨基酸同源性为97.2%~97.6%.在E蛋白有18个氨基酸位点的差异,但都位于抗原关键位点之外.通过E区段、3'NTR区段、PrM/C区段与全基因组序列进行系统进化分析均显示广西毒株均属于基因Ⅰ型乙脑病毒.结论 近年来在广西分离的乙脑病毒均属于基因Ⅰ型,与越南、四川、广东以往分离毒株的遗传进化关系较近,决定病毒毒力关键的氨基酸位点未见明显变化.