期刊简介
本刊以发表各类传染病和非传染性慢性病防治研究成果为主要内容,是中国科技论文统计源期刊和中华预防医学会系列杂志优秀期刊。
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首页>中华疾病控制杂志

- 杂志名称:中华疾病控制杂志
- 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位:中华预防医学会 安徽医科大学
- 国际刊号:1674-3679
- 国内刊号:34-1304/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), CA 化学文摘(美), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
随机生存森林在大规模基因分型肺癌预后关联性研究中的降维作用
陈干霞;张汝阳;赵杨;胡志斌;陈峰
关键词:多态性, 单核苷酸, 数据说明, 统计, 肺肿瘤
摘要:目的 探索随机生存森林在大规模测序肺癌随访研究资料中的降维效果,为进一步建立预后预测模型提供依据.方法 利用随机生存森林法对120位肺癌患者399个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点进行降维分析,筛选出重要性评分较高且错分率较低的SNPs子集,再对该子集建立多元Cox比例风险模型,并利用交叉验证法评价模型的预测效果.结果 随机生存森林法筛选出25个重要的SNPs,控制临床协变量(临床分期、是否手术、组织病理学类型)的多元Cox比例风险模型显示有4个位点有统计学意义.交叉验证结果表明,该模型的平均准确度达83.63%.结论 对高维关联性研究数据利用随机生存森林法先去噪降维,再作进一步分析,有助于后续预后预测模型的建立.
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