期刊简介

               本刊以发表各类传染病和非传染性慢性病防治研究成果为主要内容,是中国科技论文统计源期刊和中华预防医学会系列杂志优秀期刊。                

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  • 杂志名称:中华疾病控制杂志
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 安徽医科大学
  • 国际刊号:1674-3679
  • 国内刊号:34-1304/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), CA 化学文摘(美), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中华疾病控制杂志2012年第10期

SARS-CoV中性突变速率和有根系统发育树再研究及其起源的新思考

谭雅慧;孙慧敏;唐晓凤;张景霞;于晓寒;王波;夏结来;徐德忠

关键词:SARS病毒, 突变, 进化, 分子
摘要:目的 SARS-CoV起源仍未清楚,本文应用系统发育分析方法重建有根系统发育树,比对文献资料,提出SARS-CoV起源的新思考,为终找到SARS-CoV的真实起源打下基础.方法 在美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)中获取9条SARS-CoV序列.计算其同义替换核苷酸的数量(Ks值),并构建散点图,进行直线拟合,获得SARS-CoV的中性突变速率;进一步计算近共同祖先日期(time of most recent common ancestor,TMRCA),后绘制系统发育树.结果 SARS-CoV中性突变速率为7.6× 10-6/位点·天(t=18.95,P<0.001),R2 =0.98,直线拟合的可信度较高.绘制出的有根系统发育树发现有异常之处,并和有关文献无根树对照,提示SARS-CoV进化上存在“逆向进化”.结论 SARS-CoV在流行中出现“逆向进化”,SARS-CoV的起源可能是非自然性的,可能是非完全动物源性.